たぶん、バラスト代わりの水でしょう。タンカーなんかも空荷の時は船底に海水詰めてるそうですし。(出典何だっけ？かＤo)

エンジンの冷却水では？　どの場所から出ているか分からないのでなんとも言えませんが。

垢の汲みだしでは？雨水，漏水，蒸気の結露，洗浄水，トイレ等すべて舷側や

（切れた）やトランサムから船の外板を伝って流れ落とします。例外は潜水艦で一時的に耐圧タンクに汚水を溜めたあと，圧縮空気で強制排出します。

一番多いのはエンジンの冷却水ではないかな。停泊中なら、船内の電力をまかなうためのディーゼル発電機の冷却水かも知れないです。(N)