His(or Her) Majesty's Shipの頭文字ですね。日本語訳は「王室艦船」とでもなるのでしょうかね。要は大英帝国の軍隊は未だに王室に所属しているのですよ

日本なら、菊の後紋章のついてる艦は、皇室軍艦でしょうか・・・ゴミですm（）m

イギリス海軍のホームページで質問してみたところ、公式回答は「Her Majesty's Ship」でした。（お答えいただいたのはRoyalNavyのKen Johnston,Senior Press Officer）(Key)

今はエリザベス女王の時代なので「Her」なのです。男の王様の時代には自動的に「His」になります。

似た例では米艦のUSSがありますが、他にもこういうのってあるんですか