B型やD型に機種改変の基準は知りませんが、一部が最後までＡ型だったのは、Ｂ型に改造された機数・Ｄ型の新造機数が全飛行隊を改変するだけの数が作られなかったからです。
推測ですが、９０年代ともなると、旧ソ連もすでに崩壊してトムキャットが敵としたソ連爆撃機による艦隊攻撃の恐れもなくなったので、適当に旧式化しつつあるトムはほどほどの改装にとどめ、代わりに新型のホーネットを増やすことにしたのではないでしょうか。
米海軍の戦闘機では、戦闘専門（それも爆撃機が主目標）で金食い虫のトムより、当初より軽攻撃機にも使うべく開発されたホーネットの方が、戦爆両方に使えて経済的だからではないでしょうか？
ぱんてる

情報ありがとうございます
ポトリオット