「イージス艦」としていますが、AEGISの基幹部分に限って
話を進めましょう。

米軍が行うプログラム修正の情報はFMSやメーカー経由でリアルタイムに
流れます。日本側が修正をリクエストすることもあります。
アップデートの適用については防衛庁（自衛隊）側の判断となります。
(このあたりは非公開のサイトが存在します。)

ソフトのマイナーリビジョンの回数は多い、とだけ申し上げておきます。
ハードは故障時にカード単位で交換、基本的には定期修理毎に点検と
考えてください。
CSDS