単発プロペラ機は左に曲がろうとするので衝突しにくいようにするため，という説明をどこかで読みました。ただ船では士官室など高級船員室は右舷に設置する習慣ですので，艦の中枢である艦橋をどちらかに寄せるなら右舷にする，という面もあるのではないかと思います。

↑プロペラトルクの関係で飛行機が左へ行こうとするからでしょう。あと、煙突の配置と航海時の運用の関係もあって艦橋は船体中央より前にあるのが多いですね。(Key)

赤城や飛龍では左舷に設置して不評でしたから・・・ひょっとして右利きが多いからって理由なのかしら？（操縦桿右手で持ってると、なんとなく左側空いてる方がいい様な気がする＾＾;）

↑（追記）左利きでも左手で操縦桿持つ人間っていないですね、馬鹿な事書いた＾＾;

蒼龍・飛竜の艦橋位置の違いについて左だと後方乱流が飛行甲板上に多く出るとか聞いたことが有るんですけど、真偽の程はどうなのでしょう。

煙突との位置関係なのでは？他に考えにくい。

煙突と艦橋を反対舷にすると両舷の気流が乱れて着艦コース上に流れてしまう，ということではないでしょうか。両方右舷にすれば右舷気流しか乱れず，少し左から風を受ければ着艦に影響を与えませんから。