レイノルズ数は、粘性の影響を表す尺度で、物体の周りを流れる流体の流れ場の状態を規定するものです。このことから考えると、飛んでる間、全体的に影響するものと言えると思います。
　ただ、この数値は、風洞試験で、模型のレイノルズ数と実機のそれを合わせていないと、「得られる結果に意味がなくなる」ということの方が「重要」と認識しております。（形が相似でレイノルズ数が同じならば、周りを流れる流体の流れのパターンも同じになる）
　地面効果に関しては、質問3637にて紹介させて頂いております。
ＰＲＣＡ

１．の追記
　この風洞試験で、揚力係数や抗力係数等を得ることができます。レイノルズ数は、どちらかというと、この試験の方で大事な値ではないかと思っております。
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