離島からの航空機搭乗員救出や医薬品の輸送ということではないでしょうか？あと、零水偵ではありませんが、昭和１９年に二式大艇がトラック島へ赴任する高角砲要員を輸送したという体験談もありますので、似たような輸送にも使われたと思われます。
ワレアオバ

回答ありがとうございました。
人員輸送くらいしか思いつかなかったので参考になりました。
yuji