戦競時のスペシャルマーキングだと豪快なものがそろってますよ。ちょうどリンク先の「架空機の館」の掲示板で話題になった話ですから、見に行ってみると良いかと思います。かなりぶっ飛びますよ、ええ（笑）

明石耕作

　えーと、とりあえず２種類。いわゆる『部隊マーク』と、戦競や記念行事等の際に施す『スペシャル・マーキング』です。また、行事等の際に整備員等が独自に書き込む落書き的なイラストレーションもあります。
　空自の部隊マークは各国空軍の中でも派手なものだそうですけど。

＊わしが知っている主な部隊マーク：
　戦闘機部隊しか知らないんですが・・・(;^_^A
　言葉で説明するより見た方が早いかなぁ。
＜F-1＆F-2部隊＞
・第３飛行隊（三沢）　武者兜の横顔
・第６飛行隊（小松）　丸地に剣と弓矢
＜F-4EJ部隊＞
・第301飛行隊（新田原）　黄色いマフラーを巻いたカエルの顔
・第302飛行隊（沖縄）　オジロワシ
・第８飛行隊（三沢）　黒ヒョウ
＜F-15部隊＞
・第201飛行隊（千歳）　ヒグマの横顔
・第203飛行隊（千歳）　『203』＋クマを図案化
・第204飛行隊（百里）　ワシの横顔
・第303飛行隊（小松）　『６』の図案化地にドラゴン
・第304飛行隊（新田原）　天狗
・第305飛行隊（百里）　日の丸に梅花
・第306飛行隊（小松）　『６』の図案化地にイヌワシの横顔
・第22飛行隊（新田原）　ペガサス？に『Ｖ』
＜その他＞
・第501飛行隊（百里）　ウッディ・ウッドペッカー（アメコミのキャラ）
・飛行教導隊（新田原）　白いコブラの頭
・E-2C運用部隊（部隊名忘れた(;^_^A　三沢）　コウモリ
・飛行開発実験団（入間）　輪（月？）に楔型マーク

　第22飛行隊は、F-15Jのマザースコードロンであった旧第202飛行隊を改編して教育部隊としたものですが、この旧第202飛行隊の部隊マークは『武人埴輪』でした。
　空自の部隊マークには、『日の丸（国籍マーク）より小さく』という内規があり、唯一の例外は、尾翼の半分にワシを描いている沖縄の第302飛行隊だけです（一度小さくしたことがあるが元に戻ってしまった）。元々この部隊は北海道に所属し、オジロワシをイメージして現部隊マークを作りましたが、その後沖縄に移駐したことから、マニアの間では『オジロワシからカンムリワシへ』と呼ばれたそうです。

　すでにレスがありますが、空自の航空機でスペシャル・マーキングが見られる機会といえば、各隊の記念行事等の他、毎年１回開かれる『戦競（戦技競技会）』でしょう。
　まったくスペシャル・マーキングを施さずに出場する部隊もあれば、ちょこっとポイント的に入れる部隊もあり、新谷かおるや貞本義行等の著名イラストレーターや漫画家に原画を描いてもらう部隊もあります。また、マーキングの傾向も、派手なカラー・マーキングと、徹底して低視認性（ロービジ）を重視した地味なものに大別されます。
　マーキングも、部隊マーク等に由来するキャラクターや、旧部隊の部隊マークを使うなど多種多様で、仮想敵である飛行教導隊のシンボル『白コブラ』や『赤星ドクロ』をやっつける図案を取り入れる部隊も多いようです。
　ここら辺の傾向は、同じ部隊でも年度によってガラリと変わったりするので、それぞれチェックしてみるのも面白いかもしれません。
ブラック・タロン

たまたま自分はC-1と馴染みが深いのですが，彼らの尾翼に書かれているマークは中途半端に弱そうでステキ。

・入間基地のC-1：地元の猛禽類，ちょうげんぼう(ただ単に鷹か鷲かも)
・美保基地のC-1：地元の神話，因幡の白ウサギ

特に後者の，弱さ爆発なところがたまらなく好きなんです。
maNoke