基本的には開発された順番だと思いますが、ややこしいのは後継機や発展型について、基の機種の番号の１００の位の数字を増やしたものをつける例が多く見られること。例えばＭｅ１１０の後継機的存在であるＭｅ２１０、その改良型のＭｅ４１０など。ここの軍用機データベースドイツ機編が参考になります。メーカーの間で数字がだぶらないようにしているようですね。
アリエフ

補足、データベース見ていると、メーカーで連続した番号をつけていたり（例：Ｍｅ２６１，２６２，２６３）、発展型で１００番台を飛び越していきなり３００番台つけているもの（例：Ｊｕ５２の発展型Ｊｕ３５２）があったりする。お陰でＦｗ１９０の発展型にＴａ１５２とつけられたのだろうか。こりゃ、各メーカーと軍との間でいろいろなやり取りがあったからではないでしょうか。
アリエフ

でもＢｆ１６２とＨｅ１６２は重なってますが。
試作機だからかな？

Ｊ

↑最終的には航空省(RLM)の指示があったそうです。He162の場合、ハインケルとしては会社の名誉挽回の意味を込めてHe500を希望したそうですが、結局RLMの通達によって162にされてしまったという話があります。
Schump

皆様、ご回答頂きありがとうございました。
これで十数年来の疑問が氷解した思いです。
あと、Ｈｅ１６３は１６２の誤りでした。恥ずかし(^^;)
モルトケ

下記のＨＰ（英語）にこの数字のつけ方に関する説明があります。
http://www.csd.uwo.ca/~pettypi/elevon/gustin_military/gerdes.html
各メーカーごとにいくつか連続した数字を割り当てておき（データベースを見ればわかるが、ヘンシェルは１２０番台を独占している）、必要に応じメーカー同士で数字の交換を行ったそうです。また、机上プランか試作だけに終わった機に割り当ててある番号があった場合、それを他のメーカーが使うこともありました。さらに開発機が他のメーカーに譲られた場合、元のメーカーの数字をそのままつけていることもあるそうで（メーカーの略称は変わるが）。おまけに発展型について１００の位の数字を増やしたりするものだから、ややこしくなっているわけです。
アリエフ